No Shinobi Do Jutsu, por exemplo, existe uma estrutura formal de aula, um sistema de graduação e um Mokuroku (目録) que devem ser seguidos. Os exercícios são transmitidos de modo organizado e gradativo, para que o aluno possa interiorizar bem as técnicas.
Os treinamentos básicos de sala de aula são complementados com os treinamentos de campo, onde se trabalham preferencialmente as armas longas e as armas articuladas, bem como outras especializações que não têm possibilidades de serem vistas dentro do Dojo (道場).
Também são realizados treinamentos de campo com pernoite, são os chamados Gasshuku (合宿), onde se realizam palestras e exercícios direcionados a um tema específico, sendo as atividades noturnas focadas na parte mais tradicional do Ninjutsu (忍術), forçando os alunos a vivenciarem tudo aquilo que aprenderam até então.Os demais cursos seguem um padrão de aula e qualidade parecidos, podendo, ser adaptados às necessidades do contratante.
