O sistema de graduação segue o padrão Kyu/Dan, adaptado ao sistema hierarquico das famílias shinobi (genin, chunin e jonin) onde, para atingir a faixa preta, o aluno iniciante passa pelo ciclo básico de 9 graduações (kyu) - faixa branca, cinza, amarela, vermelha, laranja, verde, azul, roxa, marrom e preta. Ao atingir a faixa-preta, o sistema passa a ser o tradicional Menkyo (licenças de transmissão de conhecimentos):
3º Dan e 4º Dan: Título de Sensei (Professor) e Licença de Chuden (permissão para ensinamentos intermediários);
5º Dan e 6º Dan: Título de Sensei (Professor) e Licença de Joden (permissão para ensinamentos avançados);
7º Dan ao 9º Dan: Título de Sensei (Professor) e Licença de Okuden (permissão para ensinamentos secretos);
10º Dan: Título de Dai Sensei (Grão-Mestre ou Grande Mestre) e Licença de Menkyo Kaiden (permissão total de ensinamentos);
Sistema de Graduação do Shinobi Keiko Kai
Horas aula: Número mínimo de horas para cada graduação | Semestre: Número mínimo de semestres para cada graduação | Keiko: Número mínimo de treinos extra Dōjō para cada graduação | Gasshuku: Número mínimo de Gasshuku para cada graduação
